LOS INTERESANTES SISTEMAS CAVERNARIOS que habitan la Isla constituyen una gran atracción para los visitantes. LOS INTERESANTES SISTEMAS CAVERNARIOS que habitan la Isla constituyen una gran atracción para los visitantes. Entre estas cavernas destacan la de Santo Tomás que cuenta con más de 45 Km. de galerías situadas bajo la Sierra de Quemados, y la Cueva del Indio, que es atravesada por el río San Juan; ambas situadas en la porción más occidental. Otra de las destacadas es la cueva de Bellamar con un 23 Km. y más de 3000 años.. Cuenta con tres cavernas: Bellamar, El Jarrito y Soto Jíbaro.También cuenta con cuevas inundadas como las de los Tanques azules, próximas a la playa Guardalavaca, o la cueva submarina de Punta Francés sita en la Isla de la Juventud.
